Crear gemelos potenciales de niños y adolescentes diagnosticados de leucemia para poder simular su respuesta a cada tratamiento y predecir su evolución, probabilidad de éxito, posibles toxicidades o la evolución a largo plazo del supervivencia. Este es el objeto de Leukodomics, un proyecto que liderará el Hospital Infantil Universitario Niño Jesús de Madrid, y que intervienenel especialistas en Informática, Matemáticas, Física y Biología de la Universidad Complutense de Madrid y el I+12 (Instituto de Investigación del Hospital público 12 de Octubre), la Universidad de Castilla-La Mancha, la Universidad Francisco de Vitoria y el Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares (CNIC), coordinados por oncólogos pediátricos del Niño Jesús.
El objeto de este proyecto, que obtuvo 1,85 millones de euros de fondos europeos a través de la Agencia Estatal de Investigación, es diseñar un modelo digital que integre la información del paciente (cuál fue el diagnóstico, cómo fue la respuesta al tratamiento o cuál es su fondo genético) y la de sus células malignas (mutaciones genéticas, subprogramas de expresión génica, arquitectura del genoma y características biomecánicas).
Se trata de un modelo personalizado de predicción de la evolución del confinamiento en diferentes escenarios simulados, sin necesidad de intervención directa del paciente, minimizando el nivel de riesgo terapéutico, explicó el oncólogo Manuel Ramírez Orellana, coordinador del proyecto. Incorporated así a la research de la leucemia infantil, por primera vez, models computacionales de enfermedad y recursos informáticos procedentes de la ciencia de datos.
El problema mayor en el tratamiento en el manejo clínico de la leucemia infantil, dijo Francisco Monroy, líder del proyecto, «es la determinación de las características fenotípicas que hacen a las células leucémicas particularmente susceptibles de sufrir una recaída o un problema de infiltración del paciente en el sistema nervioso central”.
El proyecto va a secuenciar y registrar los datos genéticos, bioquímicos y biofísicos de las células cancerosas de 100 pacientes oncológicos del hospital Niño Jesús.
“Nuestro objetivo es crear un nuevo recurso que consiste en un gemelo virtual de cada paciente con leucemia aguda. La idea básica es desentrañar una herramienta que ayude al oncólogo a tomar una decisión en consulta en unos minutos”, afirmó Ramírez.
La unidad de TI del CNIC cuenta con más de 10 años de experiencia en el campo del Big Data biomédico. En concreto, Señala Fátima Sánchez-Cabo, dentro del proyecto, “trabajará con datos genéticos a nivel de célula única con la propuesta de mejorar tanto el diagnóstico como el tratamiento de los niños con leucemia”.